红树林的生态作用主要是为生物提供生产繁衍的环境，红树林还有净化海水和空气、防风消浪、促淤保滩、固岸护堤的功能，使近岸海域的含沙量减少，并能有效抵御风浪的袭击。
红树植物的根系发达，根系盘根屹立于滩涂之中，所以红树林对海浪等的冲击都有着很强的适应能力，是内陆的天然屏障，也有“海岸卫士”之称。
红树林可以吸收污染物，净化海水，防止赤潮发生。
红树林的生态系统是湿地生态系统，陆地生态和海洋生态的特性都兼具，使得红树林成为生态研究的好地方，对科普教育和发展生态旅游也有很大的影响。
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